Duas coisas me incomodavam:

1o, a scrollbar do sublime não é exibida por padrão. se vc não for control freak isso seria uma funcionalidade: ela deixa de ocupar espaço na vista e aparece apenas qdo vc precisa. O problema é q eu não queria ter q usar a roda do mouse para a scroll aparecer e, aí, poder ir onde eu quero. A scroll visivel me possibilita clicar diretamente onde quero chegar

2o a cor dificulta encontrar a scroll e clicá-la.

Vamos lá:

para torná-la visivel edite o arquivo:
Packages\Default\Preferences.sublime-settings
procure pela linha com a opção "overlay_scroll_bars" e marque como disabled

Para mudar a cor, edite o arquivo:
Packages\Theme - Default\Default.sublime-theme
e ajuste as configurações do puck_control para:

{
"class": "puck_control",
"layer0.texture": "",
"layer0.tint": [192, 32, 32],
"layer0.opacity": 1.0,
"blur": false
},
{
"class": "puck_control",
"attributes": ["horizontal"],
"layer0.texture": "",
"layer0.tint": [192, 32, 32],
"layer0.opacity": 1.0,
"blur": false
},
 
{
"class": "scroll_bar_control",
"layer0.texture": "",
"layer0.tint": [32, 32, 32],
"layer0.opacity": 1.0,
"layer0.inner_margin": [1, 1],
"content_margin": [8, 3], //makes vert scrollbar wider
"blur": false
},
{
"class": "scroll_bar_control",
"attributes": ["horizontal"],
"layer0.texture": "",
"layer0.tint": [32, 32, 32],
"layer0.opacity": 1.0,
"layer0.inner_margin": [1, 1],
"content_margin": [3, 8], //makes horiz scrollbar taller
"blur": false
},

A referência foi: 
http://sublimetext.userecho.com/topic/116003-make-the-scrollbar-markerin...